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应付销售方代垫运费应计入“应付账款”科目，也可用贷方“预付款”科目来记录。首先，运费代垫是销售方以自身货款代垫运费。换句话说，销售方把客户付的货款拿出来支付运费，也就是说客户的货款对应的运费由销售方代付。

因此，销售方应当记入贷方“应付账款”，金额为运费；借方“运费支出”，金额为运费。当客户付货款时，销售方应以贷方“应收账款”，金额为货款；借方“应付账款”，金额为货款或“预付款”，金额也为货款。

这样，销售方的应收账款减少，应付账款增加；客户的应付账款减少，应收账款增加。同时，运费也已从客户账户上被支付过，从销售方账户也被支付过。

拓展知识：应付账款与预付款的区别

首先，应付账款和预付款都属于应付账款，是企业向供应商应付的账款。但它们的区别在于：应付账款是企业与供应商已完成交易，并已经收到货款，但尚未结存的未付款项；而预付款是企业根据项目需求，将货款支付给供应商，但尚未收到货款。